El objetivo general de la Maestría en Ingeniería de Software (MIS) es atender las necesidades de los profesionales de la Industria de Software de elevar sus capacidades y conocimientos para el desarrollo de Software, además de transmitir principios, mejores prácticas, y tecnologías avanzadas de la Ingeniería de Software. 

La Maestría en Ingeniería de Software es una maestría profesionalizante. Sin embargo, el programa promueve la investigación aplicada para resolver problemas de organizaciones, gobierno, empresas y sociedad en general a través de proyectos de Software. 

Con este fin, el  programa  busca que el maestro en Ingeniería de Software: (i) tenga conocimientos sólidos que le permitan formular, desarrollar, dirigir y ejecutar experimentos en el área de Ingeniería de Software; (ii) sea capaz de investigar, recopilar, analizar e interpretar datos mediante la selección y aplicación de herramientas matemáticas, estadísticas y computacionales para establecer conclusiones con criterios científico-tecnológicos; (iii) conozca la problemática de las organizaciones y empresas a través del taller con la industria y; (iv) desarrolle soluciones para industria a través del proyecto con la industria.